More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0474 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
228 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  91.67 
 
 
228 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  76.34 
 
 
228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.34 
 
 
227 aa  332  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.11 
 
 
227 aa  329  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  75 
 
 
228 aa  325  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.11 
 
 
227 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72 
 
 
227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.75 
 
 
227 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  68.14 
 
 
227 aa  278  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  67.86 
 
 
227 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  62.05 
 
 
229 aa  263  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  61.16 
 
 
229 aa  255  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  48.23 
 
 
229 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.44 
 
 
230 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  47.53 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  49.12 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  46.9 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  47.77 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  45.98 
 
 
228 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.56 
 
 
230 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.56 
 
 
230 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  45.54 
 
 
229 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  47.09 
 
 
230 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.74 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  48.23 
 
 
231 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  48.23 
 
 
231 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  48.23 
 
 
231 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.58 
 
 
230 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  48.21 
 
 
233 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  44.69 
 
 
232 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
236 aa  185  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.84 
 
 
234 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  45.09 
 
 
231 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  44.84 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  47.32 
 
 
233 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  47.79 
 
 
229 aa  181  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.13 
 
 
229 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 
244 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  46.02 
 
 
229 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.93 
 
 
229 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  46.93 
 
 
229 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  43.36 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.61 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 
244 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  45.66 
 
 
228 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  45.66 
 
 
228 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  45.13 
 
 
232 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  45.16 
 
 
233 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  44.14 
 
 
240 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 
237 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  45.74 
 
 
253 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
223 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  47.72 
 
 
231 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  44.69 
 
 
245 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  44.14 
 
 
240 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  44.69 
 
 
245 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  44.69 
 
 
245 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  43.36 
 
 
245 aa  168  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  44.14 
 
 
245 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 
223 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  43.3 
 
 
231 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 
241 aa  165  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  42.42 
 
 
238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  40.48 
 
 
602 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.59 
 
 
221 aa  161  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  43.84 
 
 
227 aa  161  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.74 
 
 
230 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
221 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
229 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.59 
 
 
226 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.06 
 
 
221 aa  158  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.93 
 
 
226 aa  157  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
227 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  40.72 
 
 
224 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  42.79 
 
 
222 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
235 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  45.86 
 
 
601 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  40.36 
 
 
229 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  40.72 
 
 
224 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
221 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  41.28 
 
 
224 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  47.64 
 
 
230 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  40.27 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  44.8 
 
 
243 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>