More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1974 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
227 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75 
 
 
227 aa  330  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.44 
 
 
227 aa  315  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.65 
 
 
227 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.3 
 
 
227 aa  295  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  70.98 
 
 
227 aa  287  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  65.16 
 
 
228 aa  278  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  68.75 
 
 
228 aa  272  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  64.55 
 
 
228 aa  270  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  66.96 
 
 
228 aa  268  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  66.96 
 
 
227 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  62.27 
 
 
229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  59.82 
 
 
229 aa  248  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  49.34 
 
 
228 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  48.46 
 
 
229 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  50.91 
 
 
231 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  50.91 
 
 
231 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  50.45 
 
 
231 aa  203  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  46.43 
 
 
228 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  45.98 
 
 
229 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  46.67 
 
 
229 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  48.21 
 
 
230 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.57 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  45.98 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  49.55 
 
 
229 aa  198  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  48.66 
 
 
236 aa  198  7e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.09 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  48.66 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  49.09 
 
 
229 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  49.09 
 
 
229 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  49.09 
 
 
229 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  49.09 
 
 
229 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  49.09 
 
 
229 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.25 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  48.25 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.43 
 
 
230 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  48.25 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.43 
 
 
230 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  48.25 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.12 
 
 
244 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  48.25 
 
 
229 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  48.25 
 
 
229 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  49.32 
 
 
230 aa  191  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  48.25 
 
 
229 aa  191  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  46.29 
 
 
233 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  48.64 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
237 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  49.32 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.88 
 
 
244 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.88 
 
 
244 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  46.43 
 
 
233 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  44.69 
 
 
245 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  45.58 
 
 
245 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.6 
 
 
230 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  45.13 
 
 
245 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  43.11 
 
 
240 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 
228 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 
228 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  45.13 
 
 
245 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  45.98 
 
 
233 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 
231 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  46.9 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  43.69 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  46.7 
 
 
231 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  43.69 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  44.65 
 
 
233 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  43.24 
 
 
245 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
221 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.1 
 
 
226 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  44.2 
 
 
227 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
253 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.32 
 
 
223 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.05 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.13 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 
241 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  43.98 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  45.27 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
221 aa  161  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
221 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  47.81 
 
 
230 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
224 aa  158  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.31 
 
 
221 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  46.64 
 
 
228 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
221 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
229 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  44.78 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  46.67 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  41.83 
 
 
602 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.18 
 
 
227 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
628 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  41.48 
 
 
601 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.06 
 
 
230 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.44 
 
 
225 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.11 
 
 
226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>