More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3916 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3916  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0751508  normal  0.119951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3633  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  93.56 
 
 
244 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.693648  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3926  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  94.85 
 
 
244 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  83.41 
 
 
230 aa  348  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.82 
 
 
230 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.82 
 
 
230 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3726  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  83.86 
 
 
244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  73.45 
 
 
233 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  71.55 
 
 
234 aa  309  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  72.12 
 
 
233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  69.16 
 
 
231 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  71.11 
 
 
232 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  75.36 
 
 
233 aa  294  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0972  molybdate ABC transporter permease protein  74.22 
 
 
231 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.04 
 
 
230 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.84 
 
 
230 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  65.2 
 
 
253 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  64.44 
 
 
230 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3482  molybdate ABC transporter permease protein  69.33 
 
 
232 aa  272  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  68 
 
 
233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  60.18 
 
 
229 aa  268  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  60.18 
 
 
228 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  59.03 
 
 
232 aa  263  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.83 
 
 
229 aa  263  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  59.28 
 
 
229 aa  261  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  60.79 
 
 
231 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  56.95 
 
 
228 aa  259  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  60.79 
 
 
231 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  61.99 
 
 
230 aa  257  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  55.16 
 
 
229 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  60.79 
 
 
231 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  60.62 
 
 
229 aa  251  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.18 
 
 
229 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02319  molybdate ABC transporter permease protein  68.78 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  63.55 
 
 
228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  63.55 
 
 
228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  61.71 
 
 
229 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  61.71 
 
 
229 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  61.71 
 
 
229 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  61.71 
 
 
229 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  61.71 
 
 
229 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0742  molybdate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0768  molybdate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 
245 aa  238  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  56.7 
 
 
240 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2878  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  62.16 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000239207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0867  molybdate ABC transporter permease protein  62.16 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801904  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  59.01 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0791  molybdate ABC transporter permease protein  62.16 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0685  molybdate ABC transporter permease protein  62.16 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0818  molybdate ABC transporter permease protein  62.16 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2898  molybdate ABC transporter permease protein  62.16 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000308771  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  56.7 
 
 
245 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3196  molybdate ABC transporter permease protein  58.93 
 
 
245 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0431718  hitchhiker  0.000000323604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0787  molybdate ABC transporter permease protein  61.71 
 
 
229 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3539  molybdate ABC transporter permease protein  57.73 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.393524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0822  molybdate ABC transporter permease protein  57.27 
 
 
245 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000120536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0797  molybdate ABC transporter permease protein  57.27 
 
 
240 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0548556  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  52.21 
 
 
236 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  61.79 
 
 
227 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  61.09 
 
 
231 aa  228  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0213  molybdate ABC transporter permease  65.47 
 
 
239 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0551  molybdate ABC transporter permease  63.64 
 
 
231 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.112077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2721  molybdate ABC transporter permease protein  62.27 
 
 
243 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.59552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  52 
 
 
229 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.47 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3714  ABC type permease  59.01 
 
 
228 aa  194  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.17 
 
 
235 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.98 
 
 
227 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  46.4 
 
 
228 aa  185  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1617  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.88 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1458  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.89 
 
 
227 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.1 
 
 
223 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  47.95 
 
 
228 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.43 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0776  ABC-type molybdate transport protein, permease subunit  50.46 
 
 
229 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000444846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  46.09 
 
 
238 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.49 
 
 
227 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  48.53 
 
 
238 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.77 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 
228 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.06 
 
 
226 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0513  molybdate ABC transporter permease  48 
 
 
227 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  50.23 
 
 
225 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  50.23 
 
 
225 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
225 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
225 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  45.75 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2961  molybdenum ABC transporter, permease protein modB  48.86 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  48.79 
 
 
222 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 
228 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.23 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.87 
 
 
227 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  48.82 
 
 
224 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.1 
 
 
228 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.1 
 
 
228 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  46.23 
 
 
222 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.16 
 
 
223 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47 
 
 
227 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.27 
 
 
227 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>