More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0255 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0255  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
229 aa  458  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0859177 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1442  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.81 
 
 
232 aa  270  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
226 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  45.24 
 
 
238 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
227 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.72 
 
 
221 aa  167  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
224 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  41.32 
 
 
238 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.08 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.63 
 
 
226 aa  161  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
615 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.13 
 
 
222 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01610  molybdate ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 
465 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 
604 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 
604 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
628 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
228 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
228 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
485 aa  158  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103229  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
223 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
223 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
222 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  40.27 
 
 
601 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03860  molybdate ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 
530 aa  155  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.552312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
223 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 
223 aa  154  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
225 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  38.91 
 
 
602 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  43.2 
 
 
222 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  46.86 
 
 
225 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
225 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  46.86 
 
 
225 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  40.72 
 
 
232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.06 
 
 
223 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
226 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
233 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1860  molybdenum ABC transporter, permease protein ModB  34.4 
 
 
223 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.12 
 
 
224 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
225 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 
224 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  36.02 
 
 
229 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
224 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  35.55 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  35.55 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.64 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.47 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  45.63 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  35.55 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
221 aa  144  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  39.73 
 
 
228 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
224 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.6 
 
 
224 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  41.31 
 
 
224 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  38.81 
 
 
229 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  38.36 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  41.5 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 
227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  41.5 
 
 
231 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  37.8 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.51 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  36.84 
 
 
233 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
221 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  42.31 
 
 
253 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.36 
 
 
229 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  37.62 
 
 
229 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
221 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  41 
 
 
231 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
230 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  37.26 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
230 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.49 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  36.06 
 
 
233 aa  134  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.8 
 
 
227 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
616 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_003296  RS05467  hypothetical protein  49.04 
 
 
264 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  36.65 
 
 
228 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
234 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1673  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0298  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2428  molybdate ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0329  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1477  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304942  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
232 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0868  molybdate ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935801  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2565  molybdate ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.53 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  38.46 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  41.1 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  38.46 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
227 aa  128  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  36.67 
 
 
221 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  42.34 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>