More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2373 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  558  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.73 
 
 
300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  36.32 
 
 
271 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.97 
 
 
271 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
271 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  35.15 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
274 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  30.34 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  30.38 
 
 
272 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
272 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  30.22 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.26 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
550 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
545 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.82 
 
 
230 aa  82  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.97 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
742 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
545 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  27.49 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  31.03 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0954556  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
740 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
563 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  29.19 
 
 
288 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.39 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  30.73 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
565 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668504  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 
741 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  29.38 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.95 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 
741 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  30 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
226 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
741 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.995007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
728 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.32 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.59 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
743 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  27.67 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.67 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  30 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.88 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  29.56 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  29.56 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  27 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0059  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.72 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  29.01 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  23.22 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  27.52 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  29.41 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  29.58 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.89 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>