More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4841 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  100 
 
 
272 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.07 
 
 
283 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.7 
 
 
283 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  63.71 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  66.8 
 
 
282 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.32 
 
 
274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  63.22 
 
 
274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  63.32 
 
 
274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.63 
 
 
271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.6 
 
 
274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.62 
 
 
271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.9 
 
 
289 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.6 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.92 
 
 
274 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.45 
 
 
274 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.45 
 
 
274 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.45 
 
 
274 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  60.47 
 
 
271 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.55 
 
 
274 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  61.28 
 
 
289 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.32 
 
 
271 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61 
 
 
272 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.3 
 
 
267 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 
273 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.79 
 
 
274 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.33 
 
 
285 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
285 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.9 
 
 
279 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  31.9 
 
 
277 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
273 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.74 
 
 
283 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.74 
 
 
283 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.04 
 
 
278 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.6 
 
 
278 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.58 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  29.36 
 
 
288 aa  98.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.36 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.52 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.74 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.17 
 
 
297 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.43 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.46 
 
 
289 aa  95.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.28 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0582  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.38 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.513137  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.55 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0593  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.38 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.95 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3692  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.94 
 
 
291 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.28 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  31.43 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  34.36 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.93 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.7 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0557  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.96 
 
 
284 aa  92  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.49996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.74 
 
 
263 aa  92  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.77 
 
 
284 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.84 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0077  sulfate/thiosulfate transporter subunit  26.94 
 
 
276 aa  91.3  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1045  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.46 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.41 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.7 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.59 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.39 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.99 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  30.23 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.44 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4343  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.89 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279119  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.98 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.98 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  29.91 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.65 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
550 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.1 
 
 
275 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.28 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1197  sulfate ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2259  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.2 
 
 
276 aa  89  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.550519  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.87 
 
 
284 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  29.82 
 
 
277 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  29.82 
 
 
277 aa  89  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>