More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1912 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
285 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
274 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  38.06 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
274 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 
274 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
274 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
274 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
274 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.04 
 
 
289 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
274 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  37.12 
 
 
271 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
289 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.7 
 
 
271 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
274 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
271 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  37.7 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
271 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
273 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
274 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  31.16 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  31.51 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  33.09 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.2 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  29.61 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.01 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  29.44 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  35.26 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.06 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  34.13 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
758 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  34.13 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  31.76 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.16 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  37.88 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  32.11 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.45 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.26 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  29.21 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  29.21 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.83 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.93 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.93 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.58 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  32.19 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
597 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  29.78 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.31 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.77 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.21 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0922779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2609  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
565 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1181  molybdate ABC transporter permease protein  29.59 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.12 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  40.3 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1798  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.24 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0366388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.27 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  29.06 
 
 
229 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.86 
 
 
569 aa  65.1  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
574 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  29.36 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  24.73 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3201  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.424072  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2676  molybdate ABC transporter permease  33.95 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>