More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1284 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  80.84 
 
 
229 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  77.21 
 
 
226 aa  338  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2783  molybdate ABC transporter permease  74.21 
 
 
228 aa  334  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00057215  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  79.37 
 
 
228 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  78.48 
 
 
228 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  73.54 
 
 
226 aa  329  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  74.32 
 
 
226 aa  328  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  75.23 
 
 
227 aa  324  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.52 
 
 
227 aa  318  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.21 
 
 
226 aa  318  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.94 
 
 
227 aa  318  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  70.54 
 
 
226 aa  314  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  68.75 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  72.56 
 
 
226 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129462  normal  0.0470639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  71.63 
 
 
226 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2974  molybdate ABC transporter, permease protein  70.4 
 
 
226 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.06 
 
 
225 aa  308  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2027  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  78.65 
 
 
225 aa  300  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  69.01 
 
 
537 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  69.96 
 
 
232 aa  297  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.52 
 
 
226 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.07 
 
 
226 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  71.62 
 
 
226 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2887  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.43 
 
 
226 aa  293  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0388604  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  65.57 
 
 
221 aa  282  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3198  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  72.07 
 
 
226 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  67.58 
 
 
226 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.68 
 
 
228 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0964  molybdate ABC transporter permease  62.74 
 
 
229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  63.21 
 
 
228 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0707  molybdate ABC transporter permease  61.26 
 
 
228 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437925  normal  0.189063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  60.85 
 
 
229 aa  264  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  62.75 
 
 
224 aa  260  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  63.76 
 
 
226 aa  251  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4314  hypothetical protein  60.73 
 
 
228 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4417  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  63.4 
 
 
221 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  56.56 
 
 
234 aa  248  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  60.87 
 
 
223 aa  248  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  57.14 
 
 
231 aa  247  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.71 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  59.71 
 
 
229 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  61.29 
 
 
229 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.88 
 
 
228 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  55.14 
 
 
230 aa  231  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.38 
 
 
228 aa  228  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  58.79 
 
 
224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.29 
 
 
224 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.68 
 
 
220 aa  205  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.8 
 
 
221 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  46.19 
 
 
226 aa  201  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.13 
 
 
232 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.22 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.64 
 
 
225 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  57.22 
 
 
224 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.25 
 
 
226 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  52.5 
 
 
224 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01052  molybdenum ABC transporter, permease protein  52.36 
 
 
246 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569411  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  44.75 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.01 
 
 
222 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  48.82 
 
 
224 aa  185  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.8 
 
 
231 aa  185  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.13 
 
 
224 aa  184  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.24 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  43.78 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.47 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0705  molybdate ABC transporter permease  48.29 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.8 
 
 
230 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  45.66 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.58 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.58 
 
 
222 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  41.7 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  42.73 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.45 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  45.63 
 
 
226 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0223  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.21 
 
 
252 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.948647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.04 
 
 
231 aa  168  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.63 
 
 
226 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
224 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 
226 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
226 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0836  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.36 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.27 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
226 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
226 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.82 
 
 
226 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
226 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  41.74 
 
 
226 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  44.44 
 
 
223 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0942  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
218 aa  155  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000896447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
225 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
232 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0162  molybdate ABC transporter permease  49.74 
 
 
222 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171258  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0782  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.78 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
227 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>