More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0389 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.14 
 
 		 565 aa  687    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 597 aa  1142    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.01 
 
 		 634 aa  592  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.49 
 
 		 663 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54 
 
 		 606 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 		 572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 		 565 aa  174  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  33.13 
 
 		 547 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 		 540 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.85 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 569 aa  163  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.5 
 
 		 515 aa  163  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.99 
 
 		 576 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.81 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 		 547 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 		 547 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 560 aa  133  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 		 601 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 		 572 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.16 
 
 		 561 aa  120  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 518 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 		 551 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.35 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.16 
 
 		 545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  37.37 
 
 		 592 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.19 
 
 		 728 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.84 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  29.63 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  27.23 
 
 		 535 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  27.23 
 
 		 535 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  27.23 
 
 		 535 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 		 512 aa  104  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  33.6 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.9 
 
 		 516 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  36.52 
 
 		 504 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 		 579 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25.99 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 		 551 aa  98.6  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 		 575 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 		 732 aa  97.8  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  35.41 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 		 563 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 		 579 aa  95.1  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  24.31 
 
 		 516 aa  94.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  29.72 
 
 		 555 aa  94.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 		 592 aa  94.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  35.39 
 
 		 504 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.67 
 
 		 587 aa  94  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 		 758 aa  94  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.92 
 
 		 587 aa  94  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  26.35 
 
 		 536 aa  94  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.6 
 
 		 590 aa  93.6  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.83 
 
 		 742 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  26.16 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.16 
 
 		 741 aa  93.6  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  27.88 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  27.41 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.27 
 
 		 557 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  26.99 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 		 590 aa  92.8  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.6 
 
 		 590 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.41 
 
 		 589 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 		 290 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  24.11 
 
 		 556 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  35.45 
 
 		 542 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  26.35 
 
 		 536 aa  92  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  27.41 
 
 		 589 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 		 590 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 		 590 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 		 589 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 		 556 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  25.93 
 
 		 536 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  26.14 
 
 		 536 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.14 
 
 		 536 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  27.24 
 
 		 543 aa  90.9  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.63 
 
 		 743 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 		 590 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  28.98 
 
 		 590 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  28.1 
 
 		 585 aa  90.9  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.82 
 
 		 277 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  27.58 
 
 		 540 aa  90.9  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  25.93 
 
 		 536 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  27.56 
 
 		 509 aa  90.9  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  26.14 
 
 		 536 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 		 597 aa  90.9  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 		 593 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  28.29 
 
 		 589 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 740 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  37.04 
 
 		 535 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.31 
 
 		 284 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  23.87 
 
 		 572 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 		 591 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184868  normal  0.311507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>