More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3396 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
300 aa  584  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.73 
 
 
286 aa  361  9e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
274 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  31.97 
 
 
274 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 
274 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  32.86 
 
 
271 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
271 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.02 
 
 
271 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
274 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
271 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
274 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  28.92 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  29.78 
 
 
272 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.39 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  31.06 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
740 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
741 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
742 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 
741 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 
741 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  31.32 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.15 
 
 
728 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.54 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
606 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2762  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  32.18 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.665279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
314 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0954556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
565 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  29.68 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
743 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
634 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4654  sulfate ABC transporter, permease protein  29.95 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
545 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  33.33 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  27.38 
 
 
535 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  28.11 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.14 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2301  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.95 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
741 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  28.29 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
606 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  23.18 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  29.55 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2283  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.3 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  23.18 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0731  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.41 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
738 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
663 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1466  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  26.16 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  26.92 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.4 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130981  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 
557 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
547 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.85 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>