More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1934 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.14 
 
 		 597 aa  676    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 565 aa  1071    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.7 
 
 		 634 aa  554  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.12 
 
 		 606 aa  548  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.02 
 
 		 663 aa  535  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 		 572 aa  187  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  35.74 
 
 		 547 aa  180  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 		 547 aa  176  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.13 
 
 		 515 aa  170  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 		 544 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.88 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 		 540 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 		 569 aa  160  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.33 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 		 509 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.89 
 
 		 576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 		 532 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 		 601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 		 550 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 565 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  37.9 
 
 		 592 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  27.67 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  27.67 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  27.67 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 		 572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  31.62 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.37 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  25.57 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  26.38 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  28.13 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.39 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25.73 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  29.09 
 
 		 523 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.26 
 
 		 597 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  27.95 
 
 		 509 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  28.9 
 
 		 536 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  28.86 
 
 		 536 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  28.84 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  28.86 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  28.66 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.28 
 
 		 545 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  28.86 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  28.46 
 
 		 536 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  28.89 
 
 		 536 aa  107  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  26.27 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  39.33 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  28.46 
 
 		 536 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  39.33 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  38.2 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  27.55 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  39.66 
 
 		 536 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  38.61 
 
 		 542 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  29.4 
 
 		 531 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.32 
 
 		 543 aa  99  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.05 
 
 		 545 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.86 
 
 		 277 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.13 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.89 
 
 		 275 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 		 575 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  27.69 
 
 		 543 aa  95.9  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  27.55 
 
 		 536 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  27.55 
 
 		 536 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.04 
 
 		 284 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  27.35 
 
 		 536 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  27.35 
 
 		 536 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.32 
 
 		 275 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 		 588 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 		 593 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  31.36 
 
 		 535 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  31.39 
 
 		 535 aa  94  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  27.55 
 
 		 536 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 555 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  24.26 
 
 		 534 aa  92  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 		 593 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.8 
 
 		 277 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.8 
 
 		 277 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.8 
 
 		 277 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.27 
 
 		 587 aa  90.9  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3433  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.16 
 
 		 285 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  33.16 
 
 		 285 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 		 545 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1372  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.09 
 
 		 290 aa  89.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  29.11 
 
 		 545 aa  88.6  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 		 326 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.88 
 
 		 292 aa  88.2  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 		 326 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 		 326 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.26 
 
 		 227 aa  88.2  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.68 
 
 		 732 aa  87.8  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.71 
 
 		 275 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3093  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.05 
 
 		 281 aa  87  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369613  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 		 296 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>