More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6062 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  78 
 
 
741 aa  1140    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  78 
 
 
741 aa  1140    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.71 
 
 
742 aa  1171    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.95 
 
 
741 aa  1148    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.1 
 
 
741 aa  988    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.45 
 
 
743 aa  1215    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 
758 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
740 aa  1451    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.8 
 
 
728 aa  595  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.81 
 
 
615 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.88 
 
 
692 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  46.27 
 
 
700 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
692 aa  498  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  46.49 
 
 
692 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  45.06 
 
 
685 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
738 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
569 aa  345  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
563 aa  334  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
569 aa  332  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
579 aa  308  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
543 aa  276  7e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
545 aa  265  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
585 aa  198  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
677 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
586 aa  193  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.92 
 
 
551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  28.29 
 
 
568 aa  192  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  25.48 
 
 
564 aa  190  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  28.15 
 
 
583 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  27.42 
 
 
583 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 
585 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  27.42 
 
 
552 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  28.15 
 
 
583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.15 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
576 aa  185  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 
585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 
585 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
603 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
572 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
563 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.83 
 
 
587 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.83 
 
 
587 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 
574 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.03 
 
 
551 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.26 
 
 
580 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  28.22 
 
 
574 aa  168  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 
592 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.37 
 
 
592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
550 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
568 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.01 
 
 
545 aa  159  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  29.46 
 
 
574 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
550 aa  158  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
574 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  27.31 
 
 
539 aa  156  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
574 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 
608 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
600 aa  151  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.45 
 
 
574 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.99 
 
 
574 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  26.34 
 
 
575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.61 
 
 
575 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.22 
 
 
575 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
559 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.68 
 
 
574 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
551 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
570 aa  144  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.33 
 
 
580 aa  144  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.93 
 
 
544 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
564 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
561 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
732 aa  135  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.67 
 
 
551 aa  134  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.36 
 
 
547 aa  130  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
609 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 
551 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 
600 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
600 aa  127  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 
602 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.2 
 
 
611 aa  125  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.72 
 
 
616 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  24.63 
 
 
556 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  23.32 
 
 
572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.53 
 
 
556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 
575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 
606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.59 
 
 
606 aa  117  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.5 
 
 
608 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.43 
 
 
587 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
561 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
557 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  23.62 
 
 
575 aa  114  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 
592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>