More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4045 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 		 271 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.93 
 
 		 271 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.5 
 
 		 271 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  79.34 
 
 		 271 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65 
 
 		 283 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.62 
 
 		 283 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  62.26 
 
 		 274 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.75 
 
 		 274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  61.51 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  61.62 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  65.84 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.03 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  61.13 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.45 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.15 
 
 		 267 aa  293  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  60.61 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.23 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.23 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.23 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.47 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.85 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.38 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.26 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  56.85 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.43 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.39 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  37.5 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.47 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.38 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 		 574 aa  96.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4343  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.96 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  32 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.15 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  33.91 
 
 		 232 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.65 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.67 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.92 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  34.47 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  32.68 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.01 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  32.68 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  32.54 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.54 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  32.68 
 
 		 231 aa  92.4  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.9 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.421678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.38 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.88 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  34.68 
 
 		 229 aa  92  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.88 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.88 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.69 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.38 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.85 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.38 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.71 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.32 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0350  ABC transporter, inner membrane subunit  31.91 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0221605  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1065  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.83049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  32.28 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 		 550 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  34.68 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.23 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.88 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3190  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.58 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.467306 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  35.94 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0996  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.48 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0236237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.53 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.8 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.8 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.92 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>