More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3123 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
285 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.58 
 
 
274 aa  351  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.43 
 
 
273 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  55.47 
 
 
272 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.51 
 
 
283 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.14 
 
 
283 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.89 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.45 
 
 
289 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.59 
 
 
274 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.59 
 
 
274 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.59 
 
 
274 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  52.59 
 
 
274 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.33 
 
 
274 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.85 
 
 
271 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  53.73 
 
 
274 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.02 
 
 
271 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  57.02 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  52.96 
 
 
274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  58.48 
 
 
289 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.22 
 
 
274 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  52.16 
 
 
271 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.48 
 
 
274 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.87 
 
 
271 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.2 
 
 
272 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.52 
 
 
267 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
265 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
275 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
275 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 
275 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
275 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  32.13 
 
 
275 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
275 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  34.68 
 
 
226 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
273 aa  92  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  27.66 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  33.95 
 
 
232 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
290 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.43 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.51 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.6 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  31.6 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  31.11 
 
 
231 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  31.11 
 
 
231 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  31.11 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  28.63 
 
 
269 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62757  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27 
 
 
278 aa  85.5  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
280 aa  85.5  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.150151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
220 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.33 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  28.7 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.12 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.97 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  33.49 
 
 
232 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  28.25 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.56 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.79 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
269 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.84 
 
 
229 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  23.98 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.18 
 
 
223 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  30 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.23 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
551 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  25.66 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  25.66 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  31.53 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.61 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  30.96 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.45 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1182  sulfate ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.27298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1197  sulfate ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03670  sulfate transport protein CysW  28.57 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0616363  hitchhiker  0.00000000687295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1800  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  27.63 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.51 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>