More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4694 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  95.5 
 
 
289 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  62.75 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  60.31 
 
 
274 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  60.31 
 
 
274 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  60.31 
 
 
274 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  60.31 
 
 
274 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  60.31 
 
 
274 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  60.31 
 
 
274 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  60.31 
 
 
274 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  59.53 
 
 
274 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.16 
 
 
283 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.77 
 
 
283 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  59.78 
 
 
274 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.04 
 
 
274 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.52 
 
 
274 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  58.53 
 
 
274 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.14 
 
 
274 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.04 
 
 
274 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  62.4 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.04 
 
 
274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.04 
 
 
274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.67 
 
 
274 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.36 
 
 
274 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.76 
 
 
271 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  56.76 
 
 
271 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.03 
 
 
271 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.83 
 
 
271 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.79 
 
 
272 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.2 
 
 
267 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.33 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.6 
 
 
273 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.48 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  31.45 
 
 
277 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
273 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.88 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.08 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  28.83 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  32.68 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.68 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.68 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.68 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.68 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0539  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.86 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.19 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.23 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.68 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  31.19 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.56 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4913  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.33 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.22 
 
 
249 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.08 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.27 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.01 
 
 
288 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.73 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.95 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0883923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.75 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.93 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.25 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.84 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  27.8 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2259  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.22 
 
 
276 aa  89.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.550519  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.51 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.96 
 
 
221 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  38.55 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.41 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.8 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  39.16 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3093  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.39 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369613  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.33 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.08 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1065  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.01 
 
 
281 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.83049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.68 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.421678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.25 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.96 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  30.93 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.01 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0482248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.13 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.13 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.13 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.63 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0598734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3190  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.01 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.467306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.9 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>