More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3455 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
274 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.21 
 
 
273 aa  318  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.99 
 
 
285 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  56.25 
 
 
272 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.92 
 
 
283 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.2 
 
 
274 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  56.59 
 
 
274 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.98 
 
 
274 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.2 
 
 
274 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.2 
 
 
274 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  57.54 
 
 
274 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.98 
 
 
274 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.52 
 
 
283 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.59 
 
 
274 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.03 
 
 
274 aa  261  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.96 
 
 
271 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  56.42 
 
 
274 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.03 
 
 
274 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.05 
 
 
289 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.44 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  57.44 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  56.7 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  50.97 
 
 
271 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.26 
 
 
272 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 
271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.57 
 
 
267 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.6 
 
 
278 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.6 
 
 
279 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  29.2 
 
 
277 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.27 
 
 
278 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.05 
 
 
278 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.45 
 
 
284 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.74 
 
 
284 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.86 
 
 
278 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.48 
 
 
308 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.45 
 
 
283 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
273 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.45 
 
 
283 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.24 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.17 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.03 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.68 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1012  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.6 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5478  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.91 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168073  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1126  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.6 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  31.17 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.8 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
223 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.25 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1197  sulfate ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.95 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.99 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.94 
 
 
273 aa  95.5  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.44 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  33.49 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1798  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.51 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0366388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
265 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  32.17 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.75 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  35.78 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.69 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  33.49 
 
 
226 aa  92.8  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  27.2 
 
 
288 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.2 
 
 
288 aa  92.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.25 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.09 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.24 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.42 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.27 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.02 
 
 
220 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.26 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.31 
 
 
297 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2075  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.98 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157073  unclonable  1.0749900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.51 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0582  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.98 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.513137  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0593  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.98 
 
 
284 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2259  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.52 
 
 
276 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.550519  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.52 
 
 
289 aa  89  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>