More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1792 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  100 
 
 
282 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.17 
 
 
283 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.3 
 
 
283 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.96 
 
 
274 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  69.6 
 
 
274 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  69.6 
 
 
274 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  69.6 
 
 
274 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  69.6 
 
 
274 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  69.6 
 
 
274 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  69.6 
 
 
274 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  69.6 
 
 
274 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  69.49 
 
 
274 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  67.77 
 
 
274 aa  362  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  68.01 
 
 
274 aa  357  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.65 
 
 
274 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.43 
 
 
274 aa  355  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.13 
 
 
274 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.28 
 
 
274 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.54 
 
 
274 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.54 
 
 
274 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.54 
 
 
274 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  66.67 
 
 
271 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  65 
 
 
272 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.62 
 
 
271 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.5 
 
 
271 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.38 
 
 
271 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.4 
 
 
289 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.12 
 
 
272 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  62.56 
 
 
289 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.94 
 
 
267 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
273 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.97 
 
 
274 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.4 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
281 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.35 
 
 
262 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  32.02 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5067  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
307 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517347  normal  0.476874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
286 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.21 
 
 
279 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.87 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.91 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  34.92 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.49 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.14 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  32.94 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.2 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.46 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.66 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4791  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
318 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000398621  hitchhiker  0.00000336758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.61 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.66 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.91 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.63 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  34.9 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.27 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.8 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1688  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  34.66 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0527637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0634047  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.54 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0350  ABC transporter, inner membrane subunit  34.01 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0221605  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.05 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4913  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.65 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.43 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.03 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.65 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5187  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.696708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 
269 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.51 
 
 
297 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.52 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  31.25 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  33.86 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.86 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  35.26 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  35.26 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.1 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2259  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.87 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.550519  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.5 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.13 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.51 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.36 
 
 
293 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
231 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
574 aa  89  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0468  2-aminoethylphosphonate ABC transporter permease  28.91 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>