More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2649 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
274 aa  527  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  97.08 
 
 
274 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.78 
 
 
274 aa  454  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  81.39 
 
 
274 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.93 
 
 
274 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.93 
 
 
274 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.29 
 
 
274 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.93 
 
 
274 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.09 
 
 
274 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.56 
 
 
274 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  78.83 
 
 
274 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  78.1 
 
 
274 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.6 
 
 
283 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.96 
 
 
283 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  71.37 
 
 
282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  63.18 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.65 
 
 
271 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  63.32 
 
 
272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.75 
 
 
271 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.4 
 
 
271 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.02 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.94 
 
 
289 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  58.01 
 
 
289 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.92 
 
 
267 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.77 
 
 
274 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.88 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.25 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
286 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  34.63 
 
 
275 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
275 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
300 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
265 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
269 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
275 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
276 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  30.97 
 
 
269 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
276 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.84 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
306 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0634047  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5067  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
307 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517347  normal  0.476874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  31.38 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3425  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 
306 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0399054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4791  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000398621  hitchhiker  0.00000336758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5187  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  34 
 
 
306 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.696708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0350  ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0221605  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.97 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.23 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  30.53 
 
 
229 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.86 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  29.13 
 
 
228 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0268299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
306 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.039013  normal  0.0178286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4970  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374231  normal  0.0875493 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.46 
 
 
274 aa  92  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.51 
 
 
279 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.09 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  31.05 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.61 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.65 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  31.05 
 
 
231 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0586  ABC-type sulfate transport system, permease component  32.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1902  PhnU  32.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0898  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00123492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  30.11 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.88 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.6 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  35.14 
 
 
228 aa  89  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  35.14 
 
 
228 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.84 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  31.05 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  29.13 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  29.67 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  32.07 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.52 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  30.47 
 
 
232 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.17 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4913  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.32 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  30.81 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.03 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.02 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.85 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>