More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1272 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
271 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  84.5 
 
 
271 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.13 
 
 
271 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  81.55 
 
 
271 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.1 
 
 
283 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.71 
 
 
283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  62.31 
 
 
274 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  62.69 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  62.69 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  62.69 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  62.69 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  62.69 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  62.69 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  62.69 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  67.49 
 
 
282 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  63.32 
 
 
272 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.4 
 
 
274 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.04 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.04 
 
 
274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.04 
 
 
274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  62.79 
 
 
274 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.17 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  62.65 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.26 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.65 
 
 
274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.57 
 
 
274 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.15 
 
 
267 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.98 
 
 
272 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.05 
 
 
289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  56.85 
 
 
289 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 
273 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.11 
 
 
274 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.95 
 
 
285 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
286 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0079184  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
574 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
269 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
276 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  37.5 
 
 
281 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
275 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
300 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
265 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
275 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
275 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  31.71 
 
 
231 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  34.76 
 
 
232 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  35.29 
 
 
275 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 
275 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  31.71 
 
 
231 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.83 
 
 
279 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2330  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
230 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.447526 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  31.71 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0373  sulfate transport protein CysT  31.94 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  32.46 
 
 
277 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  32.6 
 
 
229 aa  99  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03680  sulfate transport protein CysT  31.48 
 
 
272 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.76 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  32.39 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.24 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4343  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.13 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279119  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
547 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2327  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.15 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000126892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.34 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.15 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0236237  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0083  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.34 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  29.26 
 
 
229 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4317  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.33 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.15 
 
 
273 aa  95.9  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.15 
 
 
229 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1097  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.28 
 
 
284 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 
293 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  32.8 
 
 
228 aa  95.5  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  32.8 
 
 
228 aa  95.5  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5077  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.49 
 
 
272 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.47 
 
 
284 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5170  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.49 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451944  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.34 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.99 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  30.66 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.33 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.18 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  28.19 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2259  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.36 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.550519  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.6 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  31.16 
 
 
314 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  35.71 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  33.53 
 
 
228 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5515  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 
230 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.62 
 
 
278 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  34.1 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0474  2-aminoethylphosphonate ABC transporter permease protein  29.76 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.976207 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0529  2-aminoethylphosphonate ABC transporter permease  29.76 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.222627  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2802  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.98 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0468  2-aminoethylphosphonate ABC transporter permease  29.76 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.46 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>