More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5485 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.55 
 
 
276 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
269 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  80.36 
 
 
275 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  80 
 
 
275 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  80 
 
 
275 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  80 
 
 
275 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  80 
 
 
275 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  80 
 
 
275 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  80.75 
 
 
265 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.64 
 
 
273 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
274 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
274 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  34.52 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
274 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
274 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.51 
 
 
271 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
274 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  33.59 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
574 aa  92.8  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.87 
 
 
289 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  32.14 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
280 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
283 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.12 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
606 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  34.57 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  32.33 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
312 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0131  ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component I  34.57 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.64 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  34.59 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
565 aa  80.1  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.853337  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
597 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  26.99 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
634 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2301  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.07 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  32.98 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
663 aa  75.5  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  27.56 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.313533  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  24.58 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  34.72 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  31.54 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  24.63 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.53 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  27.48 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.55 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.55 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>