More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4230 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
296 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  95.92 
 
 
294 aa  553  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  93.27 
 
 
302 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.82 
 
 
293 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.26 
 
 
297 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.24 
 
 
297 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.29 
 
 
312 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  72.92 
 
 
312 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  71.99 
 
 
290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.13 
 
 
293 aa  394  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.83 
 
 
314 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  66.21 
 
 
293 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.21 
 
 
293 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.24 
 
 
293 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  64.11 
 
 
330 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.37 
 
 
299 aa  329  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.67 
 
 
298 aa  275  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.29 
 
 
298 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  45.19 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 
303 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 
288 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  42.76 
 
 
316 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  41.55 
 
 
294 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.04 
 
 
283 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
279 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.08 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  37.98 
 
 
280 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
279 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.98 
 
 
280 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
275 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
334 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
280 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
279 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
279 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
280 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  38.38 
 
 
279 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  44 
 
 
279 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  36.16 
 
 
295 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  37.23 
 
 
296 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
280 aa  149  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
300 aa  146  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
574 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
272 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
265 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
275 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  31.67 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
269 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.48 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0883923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0124  ABC type transporter  29.29 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000383735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.15 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  30 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
576 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.62 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  26.69 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1399  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.83 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.63 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  24.89 
 
 
266 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  24.5 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  24.12 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1178  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  24.5 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  24.12 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1180  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  24.5 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00976508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  24.12 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  24.5 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  24.12 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1376  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078006 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.28 
 
 
282 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  25.28 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
608 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.23 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
611 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  27.96 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>