More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000663 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  100 
 
 
296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  79.05 
 
 
295 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.29 
 
 
279 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.56 
 
 
275 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.19 
 
 
279 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.19 
 
 
279 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 
280 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.55 
 
 
278 aa  318  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  55.07 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.87 
 
 
280 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.93 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  59.29 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.2 
 
 
280 aa  299  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  59.29 
 
 
279 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.95 
 
 
280 aa  292  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  45.29 
 
 
280 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
574 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
279 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
279 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  39.93 
 
 
330 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
299 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
293 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.81 
 
 
290 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
296 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
312 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  36.69 
 
 
312 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
293 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
298 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  35.96 
 
 
302 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
298 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
297 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  34.72 
 
 
294 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
297 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
293 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
293 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  37.72 
 
 
280 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
293 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
284 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
284 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
284 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
283 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  31.14 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 
294 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
334 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
272 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  27.78 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.68 
 
 
569 aa  67.4  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  29.3 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  28.04 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.95 
 
 
569 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  26.57 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
692 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.06 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.94 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.3 
 
 
282 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.41 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
587 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.52 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.8 
 
 
593 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1827  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.3 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2057  putative spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.475072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.62 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
550 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.27 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.46 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.59 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>