More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0515 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
312 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  98.4 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.22 
 
 
314 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  73.57 
 
 
294 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.29 
 
 
296 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  71.02 
 
 
302 aa  401  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.63 
 
 
290 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.78 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.75 
 
 
297 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.63 
 
 
297 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.82 
 
 
293 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  64.04 
 
 
293 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  59.32 
 
 
330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.7 
 
 
293 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.54 
 
 
293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.25 
 
 
298 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.33 
 
 
298 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  43.33 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  42.49 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
280 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
284 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
279 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
280 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
284 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
284 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.81 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
275 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
279 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
279 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
280 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  37.59 
 
 
280 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.59 
 
 
280 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
283 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  36.69 
 
 
296 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  38.38 
 
 
279 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
300 aa  149  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  43.3 
 
 
279 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  33.45 
 
 
295 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
574 aa  142  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
279 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
279 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
311 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  31.75 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
265 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  27.31 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 
551 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.09 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.09 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  26.09 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  26.09 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.37 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  32.42 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  27.37 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  27.03 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.11 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.26 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
576 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.25 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.09 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  28.24 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  32.05 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  28.85 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>