More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1103 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
280 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  52.17 
 
 
279 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  52.17 
 
 
279 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
279 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.24 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
279 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
279 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.04 
 
 
280 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  46.04 
 
 
280 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  45.29 
 
 
296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
280 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  45.65 
 
 
295 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  44.72 
 
 
279 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  44.31 
 
 
279 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
574 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
299 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  33.33 
 
 
330 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
296 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 
302 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  34.08 
 
 
294 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
297 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
293 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
297 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  32.81 
 
 
312 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
312 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
293 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  32.63 
 
 
293 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
293 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.85 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
314 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
288 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  32.16 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  29.67 
 
 
316 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
303 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
554 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
551 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
300 aa  87  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.12 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.71 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270331  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  26.5 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  32.35 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  27.53 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  26.09 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1110  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
569 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.1 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.51 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  23.86 
 
 
583 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1467  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  27.8 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347452  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.67 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  24.07 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1495  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  28.65 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  22.73 
 
 
583 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0687  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  28.37 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>