More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0753 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
279 aa  533  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
279 aa  533  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  52.17 
 
 
280 aa  293  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.45 
 
 
280 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.35 
 
 
280 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.63 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.72 
 
 
275 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.53 
 
 
279 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
279 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.37 
 
 
278 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.99 
 
 
279 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  48.53 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.16 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 
280 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  46.25 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  43.96 
 
 
296 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  45.86 
 
 
295 aa  221  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  45.45 
 
 
279 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
574 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
299 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
293 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
298 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
298 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
297 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
293 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.61 
 
 
290 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
297 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  36.53 
 
 
312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  33.72 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
312 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 
302 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  33.09 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  31.36 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 
293 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  33.69 
 
 
316 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
303 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
283 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
284 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
284 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
284 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
283 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 
265 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  26.26 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
272 aa  89  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
551 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
311 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.83 
 
 
554 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  26.95 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.51 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  25.91 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.19 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  26.92 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
587 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
569 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  27.15 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.41 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1291  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  30.96 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.89 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0308  ABC transporter, permease protein, putative  27.1 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.41 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>