More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1381 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
300 aa  570  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 
288 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  44.17 
 
 
294 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
299 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
303 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  41.79 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
293 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  38.72 
 
 
312 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
296 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
312 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.28 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
297 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  37.63 
 
 
294 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
298 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  36.73 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
284 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
284 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 
302 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
283 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
293 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  37.23 
 
 
293 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
293 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
314 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
280 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
279 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
279 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
280 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.82 
 
 
278 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
280 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.21 
 
 
280 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  32.48 
 
 
280 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  34.72 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  33.59 
 
 
279 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  35.2 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  29.21 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  29.54 
 
 
280 aa  113  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
574 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  26.32 
 
 
295 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
279 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
279 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
275 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
276 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  32.95 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
269 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
276 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.67 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  31.73 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  23.25 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  23.62 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270331  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.61 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
587 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
283 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
588 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  28.9 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.64 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  33.12 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.49 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.49 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.64 
 
 
554 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
597 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.15 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000544775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.15 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00769125  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 
283 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
274 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  24.49 
 
 
282 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  24.49 
 
 
282 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0687  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  21.62 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  27.75 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  29.02 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  29.02 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>