More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2299 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
268 aa  530  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.9 
 
 
273 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.74 
 
 
264 aa  277  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  52.26 
 
 
266 aa  272  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  52.26 
 
 
266 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  51.17 
 
 
263 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  52.14 
 
 
270 aa  265  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 
267 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  42.74 
 
 
266 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.83 
 
 
256 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.34 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  42.34 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  42.34 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  42.34 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.34 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  42.34 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
256 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.5 
 
 
258 aa  201  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
256 aa  201  9e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  39.77 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  40.77 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1286  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  41.35 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  39.77 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0325  Ornithine carbamoyltransferase  41.51 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000489255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  41.13 
 
 
266 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.94 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.52 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  40.73 
 
 
273 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1290  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  42.74 
 
 
265 aa  195  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0230868  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1644  ornithine carbamoyltransferase  38.82 
 
 
272 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  43.95 
 
 
256 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  43.5 
 
 
256 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  42.19 
 
 
266 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 
272 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  38.96 
 
 
260 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1494  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  39.6 
 
 
259 aa  192  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.968283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
266 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.68 
 
 
276 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  38.49 
 
 
260 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
267 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.37 
 
 
264 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.83 
 
 
266 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
272 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.08 
 
 
254 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
269 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.27 
 
 
270 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl509  spermidine/putrescine ABC transporter permease component  38.49 
 
 
1080 aa  186  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.6 
 
 
278 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
272 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  39.22 
 
 
259 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  39.22 
 
 
259 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 
257 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
272 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1109  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 
258 aa  185  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0200  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein and spermidine/putrescine-binding protein  37.9 
 
 
1041 aa  185  7e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  38.43 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0688  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  40.76 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  41.3 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.52 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  38.31 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component domain protein  40.99 
 
 
263 aa  181  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.683929  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  43.21 
 
 
261 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
275 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
261 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
272 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0632  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  40.98 
 
 
268 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665545  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  40.45 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  37.4 
 
 
273 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  41.84 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
271 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215203  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.09 
 
 
267 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
284 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
264 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.66 
 
 
281 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.66 
 
 
281 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.87 
 
 
281 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  35.6 
 
 
286 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  36.47 
 
 
293 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
281 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.29 
 
 
256 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
271 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0193  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  43.51 
 
 
276 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
271 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00609739  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  41.38 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  39.52 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  39.52 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  39.52 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  39.52 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1064  ornithine carbamoyltransferase  42.67 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.977673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>