More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3799 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 260 aa  513  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.49 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  49.14 
 
 		 260 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  48.21 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  45 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  41.04 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  41.04 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  41.04 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  41.04 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  41.04 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  47.77 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.17 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  40.64 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.93 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.8 
 
 		 264 aa  207  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  43.67 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.8 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.37 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  47.27 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  41.95 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  43.44 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  43.44 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  43.44 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  43.44 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  45.45 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0937  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotI  43.2 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023039  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  38.43 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.54 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1276  ornithine carbamoyltransferase  43.51 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  0.197685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  42.91 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1764  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6348  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  44.77 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2811  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  44.77 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  44.4 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2908  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3018  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.6 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2993  ornithine carbamoyltransferase  44.35 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  40.49 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.75 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.98 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.98 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4661  Ornithine carbamoyltransferase  42.4 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1669  ornithine carbamoyltransferase  44.17 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.98 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  40.43 
 
 		 244 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  44.07 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7680  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  46.31 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540437  normal  0.115465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5047  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0808772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  44.07 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01122  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  44.58 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  39.53 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.53 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  42.59 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1298  putrescine ABC transporter, permease protein  42.59 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2175  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  42.59 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  42.59 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  42.59 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0110  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  42.59 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  42.59 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5177  ornithine carbamoyltransferase  43.27 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00577642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.979336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03960  polyamine transport protein PotI  42.15 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0723  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  45.19 
 
 		 309 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2017  putrescine transport system permease protein  45.19 
 
 		 309 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>