More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0980 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  69.8 
 
 		 256 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  69.41 
 
 		 256 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  57.89 
 
 		 260 aa  298  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  46.21 
 
 		 266 aa  242  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  47.92 
 
 		 266 aa  242  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  45.83 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  45.83 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  45.83 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  45.83 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.58 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  43.36 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  42.97 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.14 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  46.44 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.27 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  45.61 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  42.75 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.5 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  43.41 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  43.31 
 
 		 284 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  48.91 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  43.19 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  42.54 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  40.84 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  45.83 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  41.67 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  42.26 
 
 		 287 aa  204  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.32 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  44.4 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  44.58 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  43.37 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.08 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  45.65 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  44.87 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.69 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  45 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  46.03 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  41.89 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01122  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  43.87 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  44.4 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  44.4 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.83 
 
 		 273 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  41.34 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  43.3 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  39.76 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03960  polyamine transport protein PotI  41.77 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  43.03 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  39.31 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  39.31 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  39.31 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.37 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  39.31 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0395  polyamine transport protein PotI  41.37 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  44.21 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  41.2 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1637  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  45.78 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  40.08 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  41.25 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0349  ornithine carbamoyltransferase  40.51 
 
 		 295 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  44.13 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>