More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3949 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.96 
 
 		 281 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  65.82 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  42.8 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.8 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.8 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  42.42 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  42.42 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  42.42 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  42.42 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  42.05 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  45.8 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  45.49 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 		 266 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  45.8 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  45.7 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  43.67 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  45.7 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.77 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  45.8 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  40.24 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.16 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.46 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.44 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  46.09 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  46.09 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.26 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.21 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  43.91 
 
 		 273 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  42.67 
 
 		 273 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  42.98 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  43.1 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  43.48 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 		 259 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.06 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  42.45 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  38.06 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.74 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  41.85 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.52 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 		 261 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.65 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1648  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  44.96 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.256197 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.32 
 
 		 256 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.28 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  40.08 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.28 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.28 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.68 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  40.16 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.02 
 
 		 244 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0395  polyamine transport protein PotI  37.98 
 
 		 289 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  42.32 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  40.25 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.61 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  42.55 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0937  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotI  40.59 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023039  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1012  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.08 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03960  polyamine transport protein PotI  39.37 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.83 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  40.96 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2004  Ornithine carbamoyltransferase  42.02 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  38.93 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.5 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.0890799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01122  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4708  Ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4661  Ornithine carbamoyltransferase  40.17 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.96 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  40.36 
 
 		 262 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  42.08 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1695  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.7 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.714449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  42.08 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  42.08 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  42.08 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>