More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1644 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1644  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
272 aa  545  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0325  Ornithine carbamoyltransferase  65.65 
 
 
268 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000489255  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0632  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  67.82 
 
 
268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.38 
 
 
267 aa  332  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1494  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  63.67 
 
 
259 aa  331  8e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.968283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0193  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
276 aa  328  7e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1286  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  62.06 
 
 
266 aa  326  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1290  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  63 
 
 
265 aa  322  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0230868  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1109  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  62.07 
 
 
258 aa  315  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.42 
 
 
269 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0688  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  51.14 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.27 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.27 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  48.56 
 
 
266 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  47.74 
 
 
266 aa  222  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  43.31 
 
 
263 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
264 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
273 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
268 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.2 
 
 
256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.5 
 
 
257 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  40.89 
 
 
270 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  39.93 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.31 
 
 
266 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.02 
 
 
256 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.23 
 
 
258 aa  178  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  38.62 
 
 
256 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.71 
 
 
254 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component domain protein  39.74 
 
 
263 aa  176  5e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.683929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 
262 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.73 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  37.92 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  37.41 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.24 
 
 
256 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  34.62 
 
 
266 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  38.52 
 
 
269 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  40.08 
 
 
256 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  36.33 
 
 
260 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  41.05 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  39.67 
 
 
256 aa  165  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.57 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.57 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.57 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.57 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  33.46 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.04 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  38.36 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1345  Ornithine carbamoyltransferase  37.55 
 
 
280 aa  161  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.593277  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  38.21 
 
 
262 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.12 
 
 
256 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
264 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1159  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.21 
 
 
255 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000268862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01122  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37 
 
 
264 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  39.43 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0200  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein and spermidine/putrescine-binding protein  35.21 
 
 
1041 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.82 
 
 
256 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
266 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
259 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  36.71 
 
 
256 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
260 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  39.6 
 
 
258 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  37.6 
 
 
259 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  37.6 
 
 
259 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
275 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
271 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
271 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1141  hypothetical protein  36.03 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  36.29 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1637  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.3 
 
 
268 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1033  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.34 
 
 
281 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1146  hypothetical protein  36.03 
 
 
255 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0953  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.34 
 
 
281 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1014  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.34 
 
 
281 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
271 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0985  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.34 
 
 
281 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
271 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  33.46 
 
 
271 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 
257 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  33.46 
 
 
271 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  33.46 
 
 
271 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  33.46 
 
 
271 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  32.79 
 
 
244 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
271 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>