More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0372 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
261 aa  504  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  62.35 
 
 
256 aa  332  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  62.35 
 
 
256 aa  331  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0566  ornithine carbamoyltransferase  63.14 
 
 
256 aa  291  8e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.6 
 
 
261 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.35 
 
 
267 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
273 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.54 
 
 
264 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
266 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.72 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  43.72 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  43.72 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  43.72 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  43.72 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.72 
 
 
266 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.72 
 
 
266 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.72 
 
 
266 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  41.25 
 
 
260 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 
266 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  41.52 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  44.96 
 
 
263 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  43.03 
 
 
266 aa  195  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  41.07 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.91 
 
 
270 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.82 
 
 
257 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.29 
 
 
266 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
268 aa  192  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  43.03 
 
 
266 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  41.41 
 
 
256 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.62 
 
 
264 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  40.42 
 
 
273 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  39.06 
 
 
273 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.18 
 
 
254 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 
257 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1494  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  41.06 
 
 
259 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.968283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.23 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  45.62 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.43 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.36 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.27 
 
 
256 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0325  Ornithine carbamoyltransferase  40.08 
 
 
268 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000489255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.4 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1141  hypothetical protein  42.17 
 
 
255 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1146  hypothetical protein  42.61 
 
 
255 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.8 
 
 
273 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  37.76 
 
 
260 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  38.31 
 
 
293 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.08 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.7 
 
 
256 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
259 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1644  ornithine carbamoyltransferase  39.51 
 
 
272 aa  179  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.55 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.55 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  38.7 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.55 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.16 
 
 
256 aa  178  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  40.42 
 
 
272 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1286  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  40.24 
 
 
266 aa  178  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  41.28 
 
 
259 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.84 
 
 
256 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
264 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  41.28 
 
 
259 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  39.21 
 
 
272 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  38.67 
 
 
271 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
272 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  39.58 
 
 
273 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.82 
 
 
267 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  38.87 
 
 
284 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  40.17 
 
 
244 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
281 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  39.92 
 
 
258 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0632  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  41.91 
 
 
268 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  40.08 
 
 
271 aa  175  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
272 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
260 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
269 aa  175  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  38.02 
 
 
266 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  40.34 
 
 
288 aa  175  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  40.69 
 
 
288 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  38.71 
 
 
274 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0193  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  40.76 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0688  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  37.35 
 
 
270 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
269 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
269 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component domain protein  45.73 
 
 
263 aa  171  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.683929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
271 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
261 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  38.74 
 
 
270 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  38.68 
 
 
287 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1290  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  39.83 
 
 
265 aa  168  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0230868  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
271 aa  168  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1695  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.33 
 
 
281 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.714449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  36.71 
 
 
276 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  37.15 
 
 
286 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>