More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2802 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
284 aa  564  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  71.21 
 
 
264 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  69.14 
 
 
244 aa  346  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  43.24 
 
 
266 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.19 
 
 
267 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
266 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  43.18 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  44.76 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
272 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1371  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  42.7 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  50 
 
 
262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  42.74 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
266 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
261 aa  212  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0953  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.82 
 
 
281 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1014  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.82 
 
 
281 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1033  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.82 
 
 
281 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.95 
 
 
281 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.95 
 
 
281 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0985  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.82 
 
 
281 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.95 
 
 
281 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.31 
 
 
273 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2284  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.82 
 
 
281 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.408593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  43.03 
 
 
271 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  41.98 
 
 
266 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1648  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.55 
 
 
281 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.256197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  41.53 
 
 
272 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
272 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
271 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
275 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1261  Ornithine carbamoyltransferase  42.35 
 
 
273 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1695  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.7 
 
 
281 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.714449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0917  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.2 
 
 
281 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2383  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.04 
 
 
281 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  40.82 
 
 
288 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
273 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
264 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  41.67 
 
 
272 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
269 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  40.32 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1961  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.58 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1345  Ornithine carbamoyltransferase  40.87 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.593277  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  42.67 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  42.41 
 
 
272 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  39.34 
 
 
260 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.64 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  40.64 
 
 
271 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  40.64 
 
 
271 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  40.64 
 
 
271 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  40.64 
 
 
271 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  43.91 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  40.08 
 
 
271 aa  198  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0885  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.95 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.110855  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0960  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.95 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2739  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.95 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.116908  normal  0.55547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00862  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.95 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2474  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.95 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.539431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2785  Ornithine carbamoyltransferase  41.95 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0929  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.95 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.57 
 
 
281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.373208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1064  ornithine carbamoyltransferase  41.91 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00868  hypothetical protein  41.95 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
271 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
271 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
271 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.5 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.45 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  43.35 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  43.53 
 
 
289 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  39.92 
 
 
271 aa  195  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 
264 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
272 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
259 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
259 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.69 
 
 
257 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  40.5 
 
 
260 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  42.49 
 
 
256 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  43.5 
 
 
274 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1134  ornithine carbamoyltransferase  41.54 
 
 
275 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0349  ornithine carbamoyltransferase  37.7 
 
 
295 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2993  ornithine carbamoyltransferase  38.49 
 
 
279 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  39.77 
 
 
270 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 
271 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215203  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  36.8 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.4 
 
 
254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  41.67 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  39.69 
 
 
276 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
271 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.977673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>