More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2367 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 
587 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.84 
 
 
588 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
597 aa  1164    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.8 
 
 
593 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
606 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
593 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
596 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
591 aa  263  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621124  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
669 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
591 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184868  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
588 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0237049  normal  0.467133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
301 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.87 
 
 
275 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 
301 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
272 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 
274 aa  190  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
272 aa  190  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
290 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0645  polyamine ABC transporter, permease protein  43.25 
 
 
279 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.11 
 
 
278 aa  185  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
424 aa  185  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
279 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2359  putative polyamine ABC transporter, permease protein  43.25 
 
 
289 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2498  putative polyamine ABC transporter, permease protein  43.25 
 
 
289 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
275 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0812  polyamine ABC transporter, permease protein  43.25 
 
 
279 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.4 
 
 
274 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
275 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  42.15 
 
 
417 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
279 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
417 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.15 
 
 
314 aa  180  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.56 
 
 
282 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  43.56 
 
 
282 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
282 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
279 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471707  normal  0.190136 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
279 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.644272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.46 
 
 
303 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2930  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  42 
 
 
279 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
275 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
275 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.776443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
283 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
541 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  39.92 
 
 
271 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
288 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003666  probable permease of ABC transporter  38.52 
 
 
282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
275 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  41.7 
 
 
426 aa  174  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
283 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.93 
 
 
406 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
275 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
294 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
413 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
281 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
281 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
278 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735344  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
281 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
301 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
303 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
283 aa  171  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153195  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
295 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0510016  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
305 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
276 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282406  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
305 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
270 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2167  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  42.37 
 
 
278 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00407242  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
279 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.853337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
416 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
281 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
305 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
305 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
278 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445054  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
278 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708074  normal  0.0941502 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  35.57 
 
 
281 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2360  putative polyamine ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
422 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275923  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0433  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2499  putative polyamine ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574113  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0484  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
278 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
411 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
424 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370122  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.23 
 
 
421 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
274 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
296 aa  167  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
291 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2931  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  40.09 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1220  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.23 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
415 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155483  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
295 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257053  normal  0.557332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4613  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.57 
 
 
415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.993847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  34.78 
 
 
281 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
272 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>