More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3648 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.4 
 
 
290 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.48 
 
 
301 aa  362  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  67.83 
 
 
301 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.26 
 
 
302 aa  349  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.4 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
293 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.54 
 
 
418 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
295 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
416 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
413 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.03 
 
 
422 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.633443  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2666  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  38.95 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393724  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.03 
 
 
422 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030853  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
417 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
420 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
290 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
423 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  45.09 
 
 
417 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
290 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
420 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156739  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.22 
 
 
318 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
420 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
541 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.42 
 
 
418 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.42 
 
 
418 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.42 
 
 
418 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
597 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2499  putative polyamine ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 
419 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0433  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2168  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  48.87 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0193763  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0484  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2360  putative polyamine ABC transporter, permease protein  51.55 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6090  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  39.59 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.52 
 
 
423 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0644  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  51.03 
 
 
419 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2931  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  49.48 
 
 
422 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.66 
 
 
330 aa  182  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
283 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 
446 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0108621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 
298 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 
462 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
305 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
587 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.74 
 
 
420 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193876  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.653272  normal  0.230244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1732  transport system permease transmembrane protein  52.06 
 
 
420 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0286401  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5123  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.98 
 
 
415 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0230497  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  43.87 
 
 
322 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
303 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  42.86 
 
 
426 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  44.71 
 
 
303 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  42.39 
 
 
271 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4613  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.2 
 
 
415 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.993847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
416 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
415 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
296 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
415 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155483  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
291 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
308 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
285 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0564  polyamine ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 
415 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
415 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
415 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.966966 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
588 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0237049  normal  0.467133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 
527 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.64 
 
 
406 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480866  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
424 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370122  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
415 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1612  spermidine/putrescine ABC transporter permease  43.87 
 
 
392 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
304 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
301 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
303 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 
424 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457285 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0328  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  44.34 
 
 
412 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 
291 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
411 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
301 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
557 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347255  normal  0.330105 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.73 
 
 
286 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
299 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
302 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.33 
 
 
424 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
422 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
317 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
422 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
302 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1884  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  45.87 
 
 
424 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.343799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>