More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003667 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  100 
 
 
426 aa  869    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  45.86 
 
 
417 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
424 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370122  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4613  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.13 
 
 
415 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.993847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5123  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.63 
 
 
415 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0230497  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.26 
 
 
406 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
417 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0564  polyamine ABC transporter, permease protein  48.38 
 
 
415 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.61 
 
 
424 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
424 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 
415 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0749  polyamine ABC transporter permease  47.39 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.87 
 
 
433 aa  355  8.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.87 
 
 
430 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.38 
 
 
415 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.966966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 
424 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07890  putative permease of ABC transporter  47.15 
 
 
415 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1884  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  51.34 
 
 
424 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.343799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.42 
 
 
411 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
415 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.653272  normal  0.230244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
415 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155483  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0108621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
415 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2931  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  44.55 
 
 
422 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
420 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156739  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
420 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2168  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  44.78 
 
 
418 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0193763  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
462 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
422 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030853  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
418 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
423 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
418 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 
422 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.633443  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
418 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
418 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0433  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 
419 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 
419 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 
419 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2360  putative polyamine ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 
419 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0484  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 
419 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2499  putative polyamine ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 
419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0644  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
423 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.27 
 
 
422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275923  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.4 
 
 
414 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
420 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
413 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
423 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1732  transport system permease transmembrane protein  44.3 
 
 
420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0286401  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1220  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.56 
 
 
421 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
421 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3108  spermidine/putrescine ABC transporter permease  44.3 
 
 
421 aa  298  9e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0328  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  40.26 
 
 
412 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
420 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193876  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.82 
 
 
557 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347255  normal  0.330105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
527 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
416 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1612  spermidine/putrescine ABC transporter permease  38.84 
 
 
392 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
389 aa  259  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
393 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
301 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  46.51 
 
 
301 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
290 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
597 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
283 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
294 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.96 
 
 
314 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
288 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6090  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  42.78 
 
 
300 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
283 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
305 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
305 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
305 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
305 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
290 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
290 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.44 
 
 
318 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
298 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
593 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  45.83 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
285 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  37.78 
 
 
271 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2666  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  36.5 
 
 
284 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393724  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
587 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2210  ABC transporter, membrane spanning protein (polyamine)  39.73 
 
 
294 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0568314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
277 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
305 aa  156  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
279 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.853337  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
283 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 
282 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1399  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 
282 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>