More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2472 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.37 
 
 
296 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  62.59 
 
 
294 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.37 
 
 
293 aa  332  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.57 
 
 
293 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  61.15 
 
 
302 aa  322  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.35 
 
 
298 aa  318  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  58.27 
 
 
330 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
312 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  58.97 
 
 
312 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.05 
 
 
297 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.22 
 
 
297 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.65 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.85 
 
 
290 aa  308  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.76 
 
 
314 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.59 
 
 
293 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.16 
 
 
293 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  56.16 
 
 
293 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
288 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  49.63 
 
 
280 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
303 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
280 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  45.91 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.98 
 
 
278 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  43.71 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
280 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
279 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
279 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.04 
 
 
280 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  43.68 
 
 
280 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
275 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  46.3 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
279 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  41.73 
 
 
296 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
283 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
334 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  41.39 
 
 
316 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
284 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
284 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  38.57 
 
 
295 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
300 aa  162  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  38.4 
 
 
280 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
279 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
279 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
574 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
272 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
311 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
265 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  34.9 
 
 
275 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
273 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  31.32 
 
 
272 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5853  putative permease protein  30.6 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.784306  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.47 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1792  transport system permease transmembrane ABC transporter protein  32.71 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0652988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.22 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0245502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.97 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465395  normal  0.116122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.81 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.308344  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  28.64 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  32.33 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3433  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.18 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.12 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.51 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.51 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>