More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0864 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
308 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
284 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
302 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
296 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  36.23 
 
 
293 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
299 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0425652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
301 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
285 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.51 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  38.06 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
283 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8305  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  37.39 
 
 
285 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
283 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
306 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
306 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
290 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62757  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
289 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2707  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  36.55 
 
 
259 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
306 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
290 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
588 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0237049  normal  0.467133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5402  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 
306 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.434189  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6501  ABC transporter permease  36.1 
 
 
285 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
313 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
267 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
279 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.853337  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
290 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
282 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
306 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
288 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
288 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  37.64 
 
 
282 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  36.21 
 
 
322 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 
276 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.93 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
295 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
290 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
309 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
301 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
305 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
317 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
304 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  36.6 
 
 
290 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  34.42 
 
 
309 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
283 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
301 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
301 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
301 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
299 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  35.98 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.150151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  39.11 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  35.51 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
309 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
303 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
293 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
417 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
301 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
301 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
301 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
301 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
309 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
301 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
291 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
301 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.05 
 
 
297 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
299 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  38.17 
 
 
284 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0981  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.17 
 
 
299 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
326 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
323 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1694  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.19 
 
 
321 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
305 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
303 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.33 
 
 
303 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  34.68 
 
 
326 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  34.68 
 
 
326 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.77 
 
 
317 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  34.68 
 
 
326 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
288 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.63 
 
 
290 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.279236  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
290 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  35.09 
 
 
288 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.78 
 
 
328 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
331 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>