More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1863 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
285 aa  553  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
290 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.26 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
290 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
291 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
301 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
301 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
588 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0237049  normal  0.467133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
290 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
302 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6090  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  39.42 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
308 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
294 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
301 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
296 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
299 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
305 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  34.55 
 
 
293 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
295 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.14 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
301 aa  161  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
304 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 
282 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
282 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
296 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.27 
 
 
330 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.65 
 
 
286 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
421 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
297 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1326  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.31 
 
 
287 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0226525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.05 
 
 
317 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1342  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.89 
 
 
287 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.377668 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1304  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.89 
 
 
287 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2141  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.89 
 
 
287 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1959  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.89 
 
 
277 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.18 
 
 
285 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2666  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  38.53 
 
 
284 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393724  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.61 
 
 
317 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.66 
 
 
318 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0984  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.61 
 
 
317 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0952  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.61 
 
 
317 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1032  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.61 
 
 
317 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0916  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.61 
 
 
317 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.05 
 
 
306 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
306 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
301 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 
317 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 
317 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
417 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
306 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
306 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  37.9 
 
 
426 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
301 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
306 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
301 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  39.22 
 
 
281 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
301 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
301 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
285 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000172169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1566  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.91 
 
 
287 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2478  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.91 
 
 
285 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165165  normal  0.578338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1245  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.91 
 
 
285 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.332009  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1303  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.91 
 
 
287 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
305 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.91 
 
 
287 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
269 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  38.73 
 
 
281 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.62 
 
 
319 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  36.15 
 
 
293 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.32 
 
 
286 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2001  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.91 
 
 
285 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01123  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.91 
 
 
275 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  36.15 
 
 
303 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
302 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  43.33 
 
 
417 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01131  hypothetical protein  33.91 
 
 
275 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.7 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
331 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0884  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.16 
 
 
317 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.994731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
287 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00861  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.16 
 
 
317 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00867  hypothetical protein  36.16 
 
 
317 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
301 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
328 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2740  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.16 
 
 
317 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0654072  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
301 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0959  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.16 
 
 
317 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
301 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
301 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
331 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
413 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
305 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2119  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.21 
 
 
304 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0489568  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.45 
 
 
328 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
328 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>