More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  100 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  98.29 
 
 
303 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5402  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  84.59 
 
 
306 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.434189  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.51 
 
 
306 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.16 
 
 
306 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.16 
 
 
306 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.16 
 
 
306 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.56 
 
 
302 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  82.82 
 
 
317 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  82.82 
 
 
306 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2119  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  75 
 
 
304 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0489568  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.65 
 
 
301 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.6 
 
 
301 aa  427  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.92 
 
 
301 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70 
 
 
301 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  72.13 
 
 
301 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.13 
 
 
301 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.13 
 
 
301 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48740  Polyamine transport protein PotH  78.84 
 
 
300 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.218163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.43 
 
 
301 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.43 
 
 
301 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.43 
 
 
301 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.78 
 
 
301 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.43 
 
 
301 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.97 
 
 
299 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.34 
 
 
301 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.36 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0381119  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  63.67 
 
 
319 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  62.98 
 
 
319 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.92 
 
 
285 aa  374  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00751229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.42 
 
 
267 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  64.04 
 
 
317 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00861  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.05 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.4 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0984  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.4 
 
 
317 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2740  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.05 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0654072  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0928  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.4 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1032  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.4 
 
 
317 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2475  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.05 
 
 
317 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00867  hypothetical protein  65.05 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0916  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.4 
 
 
317 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.4 
 
 
317 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0952  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.4 
 
 
317 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0884  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.4 
 
 
317 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.994731  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0959  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.05 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1694  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  65.17 
 
 
321 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1012  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  64.71 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.37913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1960  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  61.99 
 
 
324 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1647  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  62.67 
 
 
321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.16764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  60 
 
 
309 aa  361  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  59.86 
 
 
326 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  58.62 
 
 
324 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.31 
 
 
331 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.28 
 
 
324 aa  358  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  58.82 
 
 
326 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  58.82 
 
 
326 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  58.97 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  58.97 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  58.82 
 
 
326 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
328 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.07 
 
 
330 aa  355  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
328 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
328 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.28 
 
 
309 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.28 
 
 
309 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
328 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  58.97 
 
 
308 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.51 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
293 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.09 
 
 
303 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  60 
 
 
309 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.66 
 
 
309 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  58.19 
 
 
317 aa  342  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.62 
 
 
309 aa  341  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  57.04 
 
 
297 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1056  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  59.45 
 
 
309 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2308  putrescine transport system permease protein  59.66 
 
 
309 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0109  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  59.45 
 
 
309 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2121  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  59.66 
 
 
309 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1786  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  59.45 
 
 
309 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2177  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  59.66 
 
 
309 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.499843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.13 
 
 
296 aa  334  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.86 
 
 
310 aa  334  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1565  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  64.26 
 
 
321 aa  334  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2728  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  64.26 
 
 
321 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2643  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  64.26 
 
 
321 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  60.34 
 
 
322 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.94 
 
 
307 aa  328  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1365  putative putrescine transport system permease protein  59.23 
 
 
302 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.11 
 
 
303 aa  315  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1610  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0588164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.1 
 
 
304 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.16 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
303 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.29 
 
 
323 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>