More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0719 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
741 aa  1458    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.36 
 
 
742 aa  1134    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.88 
 
 
741 aa  1315    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78 
 
 
740 aa  1149    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.98 
 
 
741 aa  1070    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
758 aa  685    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.2 
 
 
743 aa  1145    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  99.33 
 
 
741 aa  1445    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.66 
 
 
728 aa  608  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
615 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.13 
 
 
692 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.22 
 
 
692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.39 
 
 
692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
692 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.8 
 
 
700 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  45.36 
 
 
692 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  43.52 
 
 
685 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
738 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
569 aa  336  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
563 aa  329  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
579 aa  310  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
543 aa  281  4e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
545 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
545 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  26.35 
 
 
564 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  27.93 
 
 
568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
677 aa  190  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  28.7 
 
 
583 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
585 aa  187  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
585 aa  187  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  28.89 
 
 
583 aa  187  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  28.89 
 
 
552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
585 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.7 
 
 
545 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  28.7 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
586 aa  183  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.76 
 
 
551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.84 
 
 
585 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
579 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 
576 aa  178  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 
603 aa  174  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.12 
 
 
587 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29.12 
 
 
587 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 
572 aa  171  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
563 aa  168  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 
574 aa  165  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.14 
 
 
551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.32 
 
 
580 aa  164  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
545 aa  163  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  28.2 
 
 
574 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 
592 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.1 
 
 
592 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
550 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
550 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  29.25 
 
 
574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  26.61 
 
 
539 aa  154  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
568 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.94 
 
 
554 aa  154  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.42 
 
 
575 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  28.31 
 
 
575 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.91 
 
 
608 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.1 
 
 
580 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
600 aa  150  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.7 
 
 
575 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 
559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
574 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.96 
 
 
574 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 
574 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.86 
 
 
551 aa  145  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.9 
 
 
574 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.42 
 
 
574 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
564 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 
561 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.05 
 
 
551 aa  141  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.18 
 
 
547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.81 
 
 
570 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.22 
 
 
544 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.7 
 
 
587 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.71 
 
 
732 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 
602 aa  130  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.74 
 
 
551 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.36 
 
 
600 aa  126  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.89 
 
 
556 aa  125  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 
556 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.49 
 
 
600 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.33 
 
 
592 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
609 aa  119  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  24.01 
 
 
575 aa  118  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
608 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.22 
 
 
561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 
616 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
606 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.19 
 
 
533 aa  111  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
611 aa  111  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  23.11 
 
 
556 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  23.11 
 
 
556 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>