More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0183 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
602 aa  1210    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.73 
 
 
608 aa  856    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
616 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
609 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
611 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
608 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.29 
 
 
561 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
569 aa  140  4.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.91 
 
 
741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 
741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
740 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 
741 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
605 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
741 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 
543 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 
575 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.61 
 
 
743 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
728 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.41 
 
 
758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.51 
 
 
742 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
545 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.67 
 
 
563 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.77 
 
 
551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.08 
 
 
561 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 
569 aa  109  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.97 
 
 
692 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
545 aa  108  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  22.8 
 
 
575 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.68 
 
 
560 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.28 
 
 
615 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.2 
 
 
579 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.53 
 
 
579 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  24.43 
 
 
572 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.32 
 
 
566 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  25 
 
 
700 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.57 
 
 
570 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.11 
 
 
692 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.96 
 
 
558 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.01 
 
 
551 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.24 
 
 
692 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.53 
 
 
692 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
563 aa  101  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.42 
 
 
564 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.88 
 
 
564 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  22.54 
 
 
589 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.59 
 
 
590 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  21.59 
 
 
590 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.52 
 
 
590 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.72 
 
 
590 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  21.54 
 
 
585 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.59 
 
 
590 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.59 
 
 
590 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.31 
 
 
590 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
547 aa  95.1  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  23.15 
 
 
685 aa  95.1  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.98 
 
 
589 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  21.5 
 
 
589 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.63 
 
 
568 aa  91.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.91 
 
 
572 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  21.4 
 
 
589 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  21.4 
 
 
589 aa  90.9  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.25 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.58 
 
 
554 aa  89  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.53 
 
 
559 aa  89.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.3 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  23.18 
 
 
692 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.31 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  22.39 
 
 
574 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.31 
 
 
521 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  21.72 
 
 
512 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.26 
 
 
543 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.9 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  22.03 
 
 
556 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.6 
 
 
589 aa  84  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.61 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.869163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.42 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  21.36 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  20.55 
 
 
589 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  20.55 
 
 
589 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.55 
 
 
589 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  21.53 
 
 
556 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  23.56 
 
 
592 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.49 
 
 
603 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.19 
 
 
603 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.83 
 
 
579 aa  80.1  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 
521 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  20.84 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  21.27 
 
 
585 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.08 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.36 
 
 
732 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  21.37 
 
 
603 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  21.03 
 
 
545 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  24.81 
 
 
539 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.3 
 
 
551 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  20.65 
 
 
583 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.18 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  20.71 
 
 
585 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.08 
 
 
571 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.706672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>