More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1807 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
732 aa  1422    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
600 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
602 aa  319  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
600 aa  317  5e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
600 aa  297  5e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
579 aa  253  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
576 aa  244  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 
572 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
564 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
544 aa  170  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.71 
 
 
554 aa  160  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 
551 aa  159  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
740 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
742 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 
543 aa  139  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  27.58 
 
 
741 aa  138  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 
741 aa  137  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
743 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
547 aa  137  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.55 
 
 
569 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.61 
 
 
587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
728 aa  130  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
579 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
569 aa  127  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  27.55 
 
 
564 aa  127  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.65 
 
 
692 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 
692 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
741 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 
545 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.51 
 
 
692 aa  120  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.22 
 
 
563 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.43 
 
 
692 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.5 
 
 
558 aa  114  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  24.01 
 
 
700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.75 
 
 
528 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.37 
 
 
585 aa  111  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 
556 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  24.42 
 
 
583 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.64 
 
 
557 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.76 
 
 
603 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.4 
 
 
551 aa  109  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
603 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 
692 aa  109  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.86 
 
 
574 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
590 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  24.76 
 
 
603 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.27 
 
 
556 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
590 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.87 
 
 
567 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  25.44 
 
 
589 aa  108  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
590 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
590 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.49 
 
 
590 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.71 
 
 
590 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.01 
 
 
589 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  23.62 
 
 
552 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  23.68 
 
 
583 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 
585 aa  106  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  23.46 
 
 
685 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.81 
 
 
570 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 
585 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 
585 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.49 
 
 
590 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  24.35 
 
 
556 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  24.59 
 
 
556 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  24.59 
 
 
556 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  24.86 
 
 
545 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 
556 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 
543 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  23.45 
 
 
583 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.52 
 
 
585 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.45 
 
 
589 aa  104  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  24.35 
 
 
556 aa  104  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  25.45 
 
 
585 aa  103  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  25.45 
 
 
589 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.46 
 
 
605 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 
589 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.28 
 
 
556 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  23.8 
 
 
556 aa  103  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
553 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.02 
 
 
606 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 
536 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 
575 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.11 
 
 
561 aa  100  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
615 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 
561 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 
606 aa  100  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
738 aa  99  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.15 
 
 
550 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  26.15 
 
 
564 aa  97.8  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 
556 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.49 
 
 
530 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
550 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
568 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.35 
 
 
559 aa  96.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
579 aa  97.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>