More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3215 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  94.36 
 
 		 603 aa  1130    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.21 
 
 		 589 aa  818    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.17 
 
 		 603 aa  1173    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.16 
 
 		 589 aa  844    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.2 
 
 		 590 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  65.57 
 
 		 589 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1259  ABC transporter, permease protein  70.21 
 
 		 589 aa  818    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  66.26 
 
 		 590 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  65.74 
 
 		 585 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.1 
 
 		 589 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  66.84 
 
 		 589 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.2 
 
 		 590 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3146  ABC transporter permease  70.21 
 
 		 589 aa  818    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.72 
 
 		 557 aa  754    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  65.39 
 
 		 589 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.38 
 
 		 590 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 603 aa  1184    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.2 
 
 		 590 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.38 
 
 		 590 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  65.39 
 
 		 589 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.56 
 
 		 590 aa  745    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  63.51 
 
 		 597 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 		 575 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  32.4 
 
 		 572 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 		 563 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 561 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1307  iron ABC transporter permease  26.52 
 
 		 578 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 		 568 aa  157  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 		 605 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.87 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 		 564 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  28.57 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 		 561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 		 570 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.114886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 		 564 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0174537  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 		 572 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.49 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.86 
 
 		 559 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495401  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 		 609 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.74 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 		 616 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 		 592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 		 575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.59 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 		 576 aa  114  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  23.23 
 
 		 556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.82 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.869163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  22.95 
 
 		 556 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  26.81 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.46 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.01 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.35 
 
 		 543 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.66 
 
 		 732 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 559 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.99 
 
 		 579 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  22.98 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 		 571 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.706672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  22.81 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 		 611 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3200  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.82 
 
 		 574 aa  100  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  23.23 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  23.23 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  23.23 
 
 		 556 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 		 588 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  22.7 
 
 		 556 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 		 568 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.96 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.05 
 
 		 556 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.83 
 
 		 554 aa  98.6  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.59 
 
 		 556 aa  98.2  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 		 530 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 		 528 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 		 600 aa  94.4  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.94 
 
 		 536 aa  93.6  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  24.02 
 
 		 564 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.57 
 
 		 692 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.77 
 
 		 545 aa  91.3  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.71 
 
 		 587 aa  90.5  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.43 
 
 		 692 aa  90.5  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.89 
 
 		 582 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.26 
 
 		 536 aa  89  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.2 
 
 		 540 aa  88.6  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.45 
 
 		 692 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.55 
 
 		 606 aa  88.2  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.16 
 
 		 728 aa  87  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.74 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.94 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.85 
 
 		 692 aa  84.7  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  22.92 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.78 
 
 		 545 aa  83.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.53 
 
 		 557 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 		 741 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>