More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0167 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
536 aa  1036    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.7 
 
 
541 aa  510  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.47 
 
 
540 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  52.77 
 
 
1057 aa  464  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.83 
 
 
545 aa  435  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
528 aa  379  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
530 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  47.37 
 
 
507 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
543 aa  274  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
523 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
530 aa  262  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
502 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
521 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
521 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
521 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
511 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
521 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  39.11 
 
 
515 aa  223  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.29 
 
 
521 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
540 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
530 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
518 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
550 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  34.81 
 
 
534 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
515 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.61 
 
 
534 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
522 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
536 aa  196  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
549 aa  193  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
526 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
526 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
568 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
526 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
503 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  29.34 
 
 
541 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  29.22 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.35 
 
 
567 aa  183  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
559 aa  183  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
565 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
538 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  33.77 
 
 
553 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.4 
 
 
562 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
562 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  30.52 
 
 
559 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
544 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
562 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
541 aa  177  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
544 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
558 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
554 aa  174  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.7 
 
 
531 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
558 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  34.69 
 
 
570 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  34.77 
 
 
570 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
543 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
550 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  34.56 
 
 
570 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 
544 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
570 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  34.56 
 
 
570 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  34.56 
 
 
570 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  29.38 
 
 
543 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
526 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
574 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
536 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  30.5 
 
 
589 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
543 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  34.2 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  31.2 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  30.31 
 
 
589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.26 
 
 
555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
562 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
563 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.22 
 
 
558 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
543 aa  163  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
542 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
589 aa  163  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
565 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.49 
 
 
545 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
530 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  35.54 
 
 
532 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
530 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
550 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
550 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
506 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.75 
 
 
561 aa  161  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
538 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.6 
 
 
538 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>