More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1981 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.43 
 
 
526 aa  1002    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
526 aa  1006    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
526 aa  1006    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.74 
 
 
536 aa  601  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.12 
 
 
533 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.67 
 
 
536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.66 
 
 
530 aa  528  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.93 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.26 
 
 
531 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 
528 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  56.21 
 
 
528 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.26 
 
 
528 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.84 
 
 
526 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.85 
 
 
525 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.85 
 
 
525 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.5 
 
 
527 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.64 
 
 
527 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  52.94 
 
 
513 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.15 
 
 
522 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.42 
 
 
518 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.92 
 
 
500 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.1 
 
 
509 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.73 
 
 
534 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  44.6 
 
 
534 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 
521 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
521 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
521 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 
503 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.25 
 
 
521 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  45.4 
 
 
532 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  42.8 
 
 
512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.27 
 
 
521 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  43.85 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  42.19 
 
 
515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
515 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.96 
 
 
511 aa  264  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
530 aa  263  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
523 aa  259  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
511 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
514 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
536 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
528 aa  237  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
543 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
541 aa  210  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
530 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
557 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
540 aa  200  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
540 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
1057 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 
533 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
530 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
536 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
506 aa  180  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  34.49 
 
 
507 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
550 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
550 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
568 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.41 
 
 
567 aa  137  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
559 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 
538 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
540 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
550 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
538 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
557 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.86 
 
 
561 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 
538 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
538 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 
538 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 
518 aa  124  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
540 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
538 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  30.31 
 
 
557 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
565 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
562 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 
550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.02 
 
 
540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  26.18 
 
 
564 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 
539 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
561 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.45 
 
 
555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
556 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 
526 aa  117  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  28.16 
 
 
589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  28.81 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  28.63 
 
 
553 aa  115  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.96 
 
 
589 aa  115  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1407  iron(III) ABC transporter permease protein  28.25 
 
 
543 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.960253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
553 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.725072  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.49 
 
 
525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.67 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>