More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2071 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
506 aa  944    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
511 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  40.73 
 
 
515 aa  249  9e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
514 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
515 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
530 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
502 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
511 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
528 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
518 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
522 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
521 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
509 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
536 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
512 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
526 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
526 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
530 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
530 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
541 aa  207  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
521 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.36 
 
 
521 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
536 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
536 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
540 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
543 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
526 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
525 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  33.54 
 
 
513 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.25 
 
 
531 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
533 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  34.22 
 
 
528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
528 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
525 aa  183  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
528 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 
532 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
527 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 
534 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
534 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 
550 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
523 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
540 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
557 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  36.49 
 
 
507 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
533 aa  156  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  34.63 
 
 
1057 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 
538 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
530 aa  153  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
549 aa  153  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
558 aa  153  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
561 aa  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
538 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  27.85 
 
 
564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.12 
 
 
538 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
568 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
500 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 
538 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.28 
 
 
567 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.84 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
562 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
559 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  30.18 
 
 
559 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.38 
 
 
555 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
540 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.06 
 
 
540 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  29.98 
 
 
529 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.42 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  27.93 
 
 
543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
556 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 
521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  30.25 
 
 
553 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0654  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.25 
 
 
589 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.37 
 
 
562 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  28.27 
 
 
541 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
560 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
560 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
553 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
546 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  27.05 
 
 
589 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
558 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
567 aa  125  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 
539 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
506 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
528 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
542 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
570 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
544 aa  123  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.553372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
552 aa  123  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.778216  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.4 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>