More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3649 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
500 aa  924    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.34 
 
 
518 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.21 
 
 
509 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 
522 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.81 
 
 
536 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 
530 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.72 
 
 
526 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.52 
 
 
526 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.52 
 
 
526 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.42 
 
 
531 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.96 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 
536 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  51.88 
 
 
528 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
526 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.88 
 
 
528 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 
525 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  51.88 
 
 
528 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.31 
 
 
530 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.08 
 
 
527 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.83 
 
 
525 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.98 
 
 
526 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 
533 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  47.39 
 
 
513 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.44 
 
 
521 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 
521 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.92 
 
 
534 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  48.7 
 
 
534 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  47.38 
 
 
512 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.64 
 
 
521 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.15 
 
 
521 aa  319  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
503 aa  316  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  49.6 
 
 
532 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  44.59 
 
 
502 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.4 
 
 
515 aa  293  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
523 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
530 aa  283  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
536 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  43.32 
 
 
515 aa  262  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
528 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
514 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
511 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
541 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
543 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
530 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
536 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
506 aa  207  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.99 
 
 
557 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  37.21 
 
 
1057 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
540 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
545 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.73 
 
 
567 aa  167  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
550 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
550 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  25.33 
 
 
533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  34.07 
 
 
507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
549 aa  150  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
559 aa  149  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
568 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  32.26 
 
 
553 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
561 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
528 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  26.14 
 
 
564 aa  143  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
550 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
538 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
554 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
544 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
544 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  30.21 
 
 
529 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
544 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  23.69 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
562 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
538 aa  134  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  23.49 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  26.57 
 
 
541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.51 
 
 
555 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  23.7 
 
 
538 aa  130  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.9 
 
 
558 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  23.49 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 
543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.6 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
570 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
546 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
553 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
540 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
550 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
533 aa  126  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
543 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>