More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2276 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
541 aa  1052    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.7 
 
 
536 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
545 aa  477  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 
540 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  49.25 
 
 
1057 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.4 
 
 
528 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
530 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
536 aa  356  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  44.72 
 
 
507 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
543 aa  313  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
523 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
521 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
521 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
521 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
557 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 
502 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
530 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
521 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  38.12 
 
 
515 aa  237  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
540 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  32.74 
 
 
541 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
530 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  33.27 
 
 
541 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
512 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.4 
 
 
521 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
500 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
536 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
503 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
550 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
568 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
561 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
541 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
538 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  29.45 
 
 
564 aa  206  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  34.53 
 
 
534 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
514 aa  203  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
534 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
515 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
543 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.47 
 
 
567 aa  196  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
526 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 
544 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
526 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
526 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
544 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
543 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
543 aa  190  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
562 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
533 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
553 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
522 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
542 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
558 aa  187  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.76 
 
 
559 aa  186  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
530 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
544 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.41 
 
 
555 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.744333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.99 
 
 
531 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
538 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
570 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
538 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 
533 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3006  iron(III) ABC transporter, inner membrane binding component  30.37 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.525048  normal  0.629796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
526 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
527 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1013  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
542 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0312612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
543 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
563 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
555 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
582 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  32.04 
 
 
553 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
543 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
536 aa  170  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.14 
 
 
538 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  34.19 
 
 
532 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
554 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
550 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
543 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
562 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  27.43 
 
 
555 aa  166  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  31.72 
 
 
559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
550 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.48 
 
 
545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
557 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
540 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>