More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8129 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  100 
 
 
502 aa  939    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  52.43 
 
 
515 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.56 
 
 
511 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
515 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 
511 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
521 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
521 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
521 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
536 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.49 
 
 
528 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.77 
 
 
514 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
536 aa  319  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
530 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
518 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  43.57 
 
 
512 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
521 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.28 
 
 
521 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 
500 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
503 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
526 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
526 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
526 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
522 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.01 
 
 
531 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
530 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  43.07 
 
 
534 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
543 aa  274  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
536 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
534 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
530 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
541 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
527 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
526 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  42.8 
 
 
532 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
526 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
527 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
528 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
525 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
528 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  39.34 
 
 
528 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
533 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
525 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  40.41 
 
 
1057 aa  240  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  36.72 
 
 
513 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
540 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
545 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 
530 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
557 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
540 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
506 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
530 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  37.39 
 
 
507 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
550 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.71 
 
 
567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
568 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
538 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  32.12 
 
 
553 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
559 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
561 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  28.48 
 
 
564 aa  152  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
538 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.35 
 
 
555 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
563 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
533 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0400876  hitchhiker  0.00000113394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 
538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
550 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.85 
 
 
562 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.35 
 
 
536 aa  147  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
558 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
568 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
562 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
562 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  33 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  33 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  33 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  32.68 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  33 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
554 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  32.81 
 
 
570 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
540 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
558 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
540 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
589 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
540 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 
533 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
556 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  26.68 
 
 
541 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.11 
 
 
538 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  29.91 
 
 
529 aa  137  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
565 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
562 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
582 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>